作为山东省重点大学，山东农大近几年来科技创新坚持“六个结合”战略，即坚持科技创新与经济建设服务紧密结合，科技创新与人才培养紧密结合，科技创新与创新团队建设紧密结合，基础研究与应用研究紧密结合，高新技术与传统技术紧密结合，管理服务与宏观指导紧密结合，找准结合点，提高自主创新能力。
　　最近几年，学校到位科研经费1.75亿元，是“九五”的2.9倍。争取国家自然科学基金项目78项，获资助经费1682.5万元，是“九五”的5倍，一直位居省属高校首位。学校获得各级科技成果奖励116项。其中国家科技进步二等奖3项；省部级一等奖4项、二等奖29项，三等奖42项。鉴定成果134项，其中由谭景和教授主持的“山羊体细胞克隆技术研究”成果达到国际前沿水平，有9项成果达到国际前沿和国际领先水平，40项成果达到国际先进水平，77项成果达到国内领先水平。发表科技论文4062篇，其中被SCI、EI、ISTP收录213篇。

　　搭建科技创新平台　提高自主创新能力

　　建设高水平的科技创新条件平台是取得重大创新，提升自主创新能力的重要前提。学校再投入7000万元资金打造科技创新平台，着力提高学校自主创新能力，为我国的农业现代化和建设创新型国家作出应有的贡献。
　　“十五”期间，学校在科技创新平台建设方面取得了重要进展，建成了农业部农药重点实验室、作物生物学省部共建重点实验室，山东省小麦、苹果、畜牧技术研究中心，国家玉米分中心、农业部谷物品质检测中心等多层次、多学科的科技创新平台，有力地促进了学校自主创新能力的提高和学科建设的发展。如，作物生物学省部共建重点实验室，承担国家重大重点和国家自然科学基金项目55项，科研到位经费3433万元，获得重要科研成果35项，具有自主知识产权的发明专利6项，发表学术论文260余篇，SCI收录38篇。培育经山东省品种审定委员会审定的高产优质小麦新品种5个，玉米新品种3个，棉花新品种2个，花生新品种3个，这些科研成果和新品种的推广，产生了巨大的经济与社会效益。
　　该校站在农业科技和生命科学研究的前沿，主持“华北农区(山东)奶业现代化生产技术集成与产业化示范”等80多项国家植物转基因、国家自然科学基金、国家948、国家973，农业部跨越计划、丰收计划，省自然科学基金项目。先后育成了6个多抗转基因水稻系列新品种，培育出了两批3只克隆山羊，研制出兽药专利系列产品，包膜控释肥专利系列产品，选育出了一批小麦、花生、棉花、果树、林木等具有自主知识产权的技术、品牌和农作物良种，科技创新能力进一步增强，显示出该校进入科技创新国家队的实力。
　　最近，学校决定继续投入7000万元资金，加强科研平台建设，重点打造几个科技创新平台：围绕畜禽疾病防疫和畜牧生产，组建动物生物学技术研究中心；围绕发展循环经济，促进种植业资源与新材料、新能源的研发利用，组建生物质能源技术研究中心；围绕环境友好型社会和生态环境建设，组建生态与环境技术研究中心；围绕农业信息技术的利用，组建信息技术研究中心；围绕农村管理和政策服务，整合管理、经济、法学等文科力量，组建三农研究中心。

　　组建科技创新团队　提高自主创新能力

　　建设高水平的科技创新平台，人才是根本。
　　学校实施人才强校战略，把吸引聚集高水平的学术带头人和青年学术骨干作为平台建设的首要任务，建立了开放流动与竞争激励机制。近年来，学校引进了动物防疫专家崔治中、动物胚胎工程育种专家谭敬和、植物病理专家张天宇、生物工程专家张宪省、郑成超等国内外知名专家，取得了具有我国自主知识产权的克隆山羊、转基因水稻、小麦、棉花等一批达到国际前沿水平的新品种。
　　当前，学校从事科技工作的人员1500多人，其中教授190多人，副教授370人，讲师492人，博士研究生197人，硕士研究生476人。400人主持各类科研课题1000多项。其中，有50多位教师承担国家级项目，进入了国家队，有5人成为国家“百千万人才工程”一、二层次人才，5人被聘为泰山学者。学校对教学科研骨干人员实行“1512工程”管理，从科研条件和分配政策上支持学科带头人积极进行科技创新，形成了一支充满生机和活力的科技创新团队。
　　今年年初，学校拿出3000万元设立专项资金，用于创新团队建设。比照泰山学者的条件，面向国内外招聘15名左右的特聘教授、讲座教授。特聘教授聘期五年，实行年薪制，年薪10万至30万元；自然科学特聘教授科研活动经费200万至350万元，人文社会科学特聘教授科研活动经费50万元。
　　目前，美国明尼苏达大学、美国加州SaLK生物研究所、美国Rutgers大学从事植物生物学、植物光形态及植物激素信号转导、植物栽培耕作学的3名教授被山东农大聘为特聘教授和讲座教授。

　　科技与经济建设紧密结合　提高自主创新能力

　　为农民生产发展提供更多农作物新品种、新技术、新产品，是山东农大科技创新的主攻方向。
　　学校主持完成的“冬小麦矮秆、多抗、高产新品种质‘矮孟牛’的创造及其利用研究”成果，1997年获国家技术发明一等奖。近几年对“矮孟牛”的研究和利用又取得重要进展：利用“矮孟牛”育成的小麦新品种由12个增加到16个；累计推广面积由3.09亿亩增加到4.58亿亩，年推广面积5000万亩左右，占黄淮麦区年种植面积的四分之一以上，取得显著经济社会效益。
　　二十世纪七十年代，为解决我国粮食供应不足的问题，山东农业大学把选育粮棉油作物高产、抗病、新品种，研究丰产栽培技术，作为科技创新的重点，育成鲁麦1号、鲁麦5号、鲁麦6号等16个小麦新品种，育成玉米、棉花、花生、水稻、杏、桃、樱桃、节瓜、黄瓜、辣椒、韭菜、大蒜、香瓜等50多个新品种。研制出50多个兽药、农药、饲料、肥料新产品。研究出小麦精播高产栽培技术、小麦水稻一体化亩产吨粮配套技术、黄淮海平原玉米高产栽培技术、苹果地膜覆盖穴贮肥水技术、山东省百万亩苹果幼树优质丰产综合技术等80多项农业实用新技术。这些优良品种和先进栽培技术在生产中大面积推广使用，从根本上改变了我国粮油果蔬紧缺的局面。先后获得国家技术发明一、二、三等奖，国家科技进步二、三等奖等19项国家级大奖。
　　二十世纪九十年代后期，我国农产品出现相对过剩的情况，围绕农业产业结构调整，围绕农业增效农民增收，适应加入WTO后发展绿色环保农业，生产无公害绿色食品的需求，该校科技人员在选育出我国第一个高蛋白优质面包专用小麦PH82-2-2的基础上，又选育出优质小麦新品系山农D909、山农D695等小麦新品系，以及山农凯新2号杏等果蔬新品种。同时，研究出与新品种相配套的栽培管理技术。这些新品种、新技术，通过新闻媒体传播，通过该校师生在校外教学基地的科技培训活动，把良种和技术普及到广大农村，使农民切实享受到农业新科技成果带给他们的经济实惠。